聚丙烯酰胺凝膠電泳色譜儀的載體是聚丙烯酰胺凝膠。聚丙烯酰胺凝膠是由單體丙烯酰胺(CH2 = CH-CO-NH2,簡稱Acr)和交聯(lián)劑N,N′-甲叉雙丙烯酰胺(CH2 = CH-CO-NH-CO-CH = CH2,簡稱Bis)在催化劑的作用下聚合而成的含酰胺基側(cè)鏈的脂肪族長鏈,相鄰的兩個鏈通過甲叉橋交鏈起來,鏈縱橫交錯,形成三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。參與反應(yīng)的催化劑有兩種成分,一種是引發(fā)劑,提供原始自由基,通過自由基傳遞,使單體丙烯酰胺成為自由基,引發(fā)聚合反應(yīng);另一種是加速劑,加快引發(fā)劑釋放自由基的速度。
一、合成:
聚丙烯酰胺凝膠的合成方式有化學聚合和光聚合。
1、化學聚合:
引發(fā)劑過硫酸銨(AP)在加速劑N,N,N′,N′-四甲基乙二胺(TEMED)的催化下形成氧自由基,進而使單體丙烯酰胺形成自由基,從而引發(fā)聚合反應(yīng)。
聚丙烯酰胺凝胺凝膠電泳中的分離膠(小孔膠)是通過化學聚合而成。
2、光聚合:
引發(fā)劑核黃素在加速劑TEMED和光照條件下,分解成無色的還原型(無色核黃素),在少量O2條件下,還原型核黃素被氧再氧化形成自由基,從而引發(fā)聚合反應(yīng)。但過量的氧會阻止鏈長的增加。
此法制得的凝膠篩孔大,常用作聚丙烯酰胺凝胺凝膠電泳中的濃縮膠。
3、影響聚合的因素:
(1)大氣氧能淬滅自由基,終止聚合反應(yīng),反應(yīng)液應(yīng)與空氣隔絕。
(2)有些材料如有機玻璃能抑制聚合反應(yīng),在有機玻璃容器中,反應(yīng)液和容器表面接觸的一層不能形成凝膠。
(3)某些化學物質(zhì)可減慢反應(yīng)速度如鐵氰化鉀。
(4)溫度影響聚合反應(yīng),溫度高反應(yīng)快,溫度低反應(yīng)慢。
二、性能指標:
聚丙烯酰胺凝膠的性能指標有凝膠總濃度和交聯(lián)度等。
1、凝膠總濃度(T):
凝膠總濃度表示凝膠溶液中單體和交聯(lián)劑的總百分含量。
T = [(a+b)/m]×100%
式中:a為單體的質(zhì)量(g),b為交聯(lián)劑的質(zhì)量(g),m為溶液的體積(mL)。
凝膠總濃度可在3%~30%之間變化。凝膠總濃度過高,凝膠硬而脆,容易破碎。凝膠總濃度過低,凝膠稀軟,不易操作。
凝膠總濃度主要影響篩孔的大小。實驗表明,凝膠篩孔的平均直徑和凝膠總濃度的平方根成反比。
D=kd/(T1/2)
式中:D為凝膠篩孔的平均直徑,d為多聚體分子直徑,k為常數(shù)。
2、交聯(lián)度(C):
交聯(lián)度示凝膠溶液中交聯(lián)劑占單體和交聯(lián)劑總量的百分含量。
C = [b/(a+b)]×100%
交聯(lián)度決定凝膠篩孔的最大直徑。
交聯(lián)度過高,凝膠不透明,缺乏彈性。交聯(lián)度過低,呈糊狀。要獲得透明而有合適機械強度的凝膠,單體用量高時,交聯(lián)劑量應(yīng)減少;單體用量低時,交聯(lián)劑量應(yīng)增大。
3、良好的電泳用凝膠的經(jīng)驗公式:
在100mL溶液中,Acr(g)×Bis(g)≈常數(shù)(約1.3)
最常用凝膠的組成是T=7%~7.5%,C=2%~3%。標準凝膠的組成是T=7.2%,C=2.6%,用此凝膠分離蛋白質(zhì)可得到較好的結(jié)果。
當分析未知樣品時,常用標準凝膠或4%~10%的梯度凝膠試測,然后確定合適的凝膠總濃度。
用于研究大分子核酸的凝膠多為2.4%的大孔凝膠,太軟,不易操作,可加入0.5%瓊脂糖或在3%凝膠中加入20%蔗糖,以增加機械強度而又不影響凝膠篩孔大小。
三、特點:
1、聚丙烯酰胺凝膠是人工合成的三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的凝膠,具有分子篩作用,其篩孔大小可人為控制和調(diào)節(jié),并且制備重復性好。
2、聚丙烯酰胺凝膠是碳-碳結(jié)構(gòu),沒有或很少帶有極性基因,吸附少,電荷作用小,不易和樣品相互作用,化學性質(zhì)比較穩(wěn)定。
3、凝膠無色透明,適宜用光密度掃描記錄結(jié)果,且需要樣量較少。
4、用途廣泛,具有彈性,便于操作,易于保存。
四、應(yīng)用:
聚丙烯酰胺凝膠特別適合作區(qū)帶電泳的載體,用于酶分離和分子量測定。
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