大多數分析和小規(guī)模制備生物大分子首選是臺式冷凍水平轉子離心機，它能產生強大的離心力，生物大分子在水平轉子的離心管中有較長的沉降路徑，壁效應較小，可使生物大分子獲得精確分離。為獲得最佳分辨率，樣品體積不應超過梯度體積的3%，梯度上的樣品區(qū)帶應該非常窄。

離心管尺寸和轉速不同，分離效果不同。小劑量樣品可用細長型離心管，大容量樣品可用粗短型離心管，它們都可使樣品區(qū)帶盡可能窄。然而，為了提高分辨率一味增加生物大分子的沉降路徑，會使離心時間延長。在此過程中，有些蛋白質會失去活性。隨著沉降時間的延長引起的擴散，會導致區(qū)帶變寬。

 

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